自动化专业考研最好的学校，这个问题没有一个绝对的答案，因为不同的学校在不同的领域和方向上都有其独特的优势。然而，根据近年来的排名和学科评估，以下几所学校在自动化专业方面表现尤为突出：
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清华大学：清华大学自动化系在国内外享有极高的声誉，其研究方向涵盖了控制理论与控制工程、模式识别与智能系统、导航制导与控制等多个领域。清华大学的自动化专业不仅在理论研究上处于领先地位，其实践应用也非常广泛，尤其是在智能制造、机器人技术等领域。
案例：清华大学的自动化系曾参与研发了中国首台具有自主知识产权的工业机器人，这一成果不仅提升了国内机器人产业的竞争力，也为学生提供了宝贵的实践机会。
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哈尔滨工业大学：哈工大的自动化专业历史悠久，学科实力雄厚，尤其在航天控制、机器人技术等方面具有显著优势。哈工大的自动化专业毕业生在航天、国防等领域有着广泛的应用。
案例：哈工大的自动化专业团队曾参与了中国载人航天工程的部分控制系统研发，这一经历不仅提升了学校的科研水平，也为学生提供了参与国家级重大项目的机会。
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浙江大学：浙江大学的控制科学与工程学科在国内排名一直名列前茅，其自动化专业在智能控制、网络化控制系统等领域有着深入的研究。浙大的自动化专业注重理论与实践相结合，培养了大量的高素质人才。
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上海交通大学：上海交大的自动化专业在工业自动化、智能系统等领域有着深厚的积累，其研究成果在国内外都有着广泛的影响力。上海交大的自动化专业毕业生在工业界和学术界都有着良好的口碑。
案例：上海交大的自动化专业团队曾参与了国内首个智能工厂的规划与建设，这一项目不仅展示了学校在工业自动化领域的实力，也为学生提供了实践的平台。
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北京航空航天大学：北航的自动化专业在航空航天控制、无人系统等领域有着显著的优势，其研究成果在国防和民用领域都有着广泛的应用。北航的自动化专业毕业生在航空航天、国防科技等领域有着广泛的职业选择。
案例：北航的自动化专业团队曾参与了中国首款无人机的控制系统研发，这一成果不仅提升了学校的科研水平，也为学生提供了参与国家级重大项目的机会。
综上所述，清华大学、哈尔滨工业大学、浙江大学、上海交通大学和北京航空航天大学都是自动化专业考研的优秀选择。每所学校都有其独特的优势和特色，考生可以根据自己的兴趣和发展方向进行选择。